Pythonで特徴量を作るうえで重要なPandasのDataFrameですが、
何千万行もあるような大きなデータを扱うとメモリエラーが出ますよね!
そんな方に朗報です!下のコードをコピペして
使うだけで簡単にメモリ使用量を減らすことができます。
# 必要なライブラリをインポート import pandas as pd import numpy as np import gc # メモリ使用量を削減する関数(これをコピペして使いまわせばOK) def reduce_mem_usage(df, verbose=True): numerics = ['int16', 'int32', 'int64', 'float16', 'float32', 'float64'] start_mem = df.memory_usage().sum() / 1024**2 for col in df.columns: col_type = df[col].dtypes if col_type in numerics: c_min = df[col].min() c_max = df[col].max() if str(col_type)[:3] == 'int': if c_min > np.iinfo(np.int8).min and c_max < np.iinfo(np.int8).max: df[col] = df[col].astype(np.int8) elif c_min > np.iinfo(np.int16).min and c_max < np.iinfo(np.int16).max: df[col] = df[col].astype(np.int16) elif c_min > np.iinfo(np.int32).min and c_max < np.iinfo(np.int32).max: df[col] = df[col].astype(np.int32) elif c_min > np.iinfo(np.int64).min and c_max < np.iinfo(np.int64).max: df[col] = df[col].astype(np.int64) else: if c_min > np.finfo(np.float16).min and c_max < np.finfo(np.float16).max: df[col] = df[col].astype(np.float16) elif c_min > np.finfo(np.float32).min and c_max < np.finfo(np.float32).max: df[col] = df[col].astype(np.float32) else: df[col] = df[col].astype(np.float64) end_mem = df.memory_usage().sum() / 1024**2 if verbose: print('Mem. usage decreased to {:5.2f} Mb ({:.1f}% reduction)'.format(end_mem, 100 * (start_mem - end_mem) / start_mem)) return df # DataFrameを上記関数に入れる(このように使うだけ!) df = pd.read_csv("hogehoge.csv") df = reduce_mem_usage(df)
めっちゃ簡単ですよね!データ解析コンペプラットフォームのkaggleで非常によく使われています。これ、何やってるかと言うと数値型を必要最低限の型に変換です。例えばyearというカラムがあって1900~2020が入ってるとします。pd.read_csvでそのまま読み込むと整数はint64になります。整数型で扱える範囲は下表の通りです。
dtype 説明 int8 整数(-128~127) int16 整数(-32768~32767) int32 整数(-2147483648~2147483647) int64 整数(-9223372036854775808~ 9223372036854775807) 西暦のyearならint16で十分ですね!これ、int64だと1行で64bit(8byte)メモリを使うという意味なのでint16に変換するだけでメモリを4分の1の16bitに減らせるんですね。先ほどのreduce_mem_usage関数は、DataFrameの中で整数型と浮動小数点型のカラムを見て最大値や最小値からメモリを一番減らせる型に変換するようになってます。情報量が減る心配もありませんので是非使ってみてください。
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